图像区操作
1. 放大图像:图像右侧(1/5区域),按下鼠标左键,上下移动。
2. 移动图像:图像右下角,按下鼠标左键,上下左右移动。
3. 调整图像窗宽和窗位:图像左侧(4/5区域),按下鼠标左键,上下左右移动。
4. 切换图像:载入的多幅图像,滚动鼠标滚轮进行切换。
5. 切换图像和病灶:通过键盘上的上、下、左、右按键。
ROI鼠标勾画及阈值控制
1. 添加ROI区域:按住Control键,按下鼠标左键,移动鼠标,添加ROI区域
2. 删除ROI区域:按住Shift键,按下鼠标左键,移动鼠标,删除ROI区域
3. 清除ROI:按下鼠标右键,选择菜单。
4. ROI阈值限制:选择数值或是百分比,后面输入框中,输入下阈值和上阈值。在画出ROI后,软件只会将位于上下阈值内的体素纳入ROI区域。
ROI 区域生长勾画
1. 敲击键盘‘R’键,进入区域生长模式。(再次敲击’R'键或是ESC键,退出区域生长模式)
2. 在区域生长模式下,移动鼠标,鼠标箭头之处为区域生长种子点,程序实时显示该种子点的区域生长区域范围。
3. 在区域生长模式下,滚动鼠标滚轮,调整区域生长阈值。(按下鼠标滚轮,返回初始阈值(20),如果需要精细调整阈值范围,按下键盘上“-”和“=”按钮)
4. 在区域生长模式下,点击鼠标或是敲击回车键,最终确定生长区域。
● 下载ZIP软件包,解压缩 ,无需安装
● 运行modeling.exe (创建自己的影像组学模型)
● 运行predict.exe (用创建好的模型进行疾病判断)
影像组学,主要考虑的ROI内的体素的信号特征,如:ROI形态,信号大小,纹理特征等,并不考虑ROI的解剖位置,与邻近脏器的关系,当然和没有考虑其他临床信息。所以,其诊断的价值到底有多大,在哪些方面有价值,是值得我们探究的。
影像组学技术本身由于是对ROI的信号进行计算,所以,信号稳定性必然会对结果产生干扰。虽然,我们有各种对信号的各种预处理技术,比如:标准化等等,但是也挡不住剧烈的信号变化。
影像组学也经常和基因组学联系在一起,研究肿瘤。背后的机理就是,肿瘤的异质性,会反应到图像异质性,这些异质性也许可以通过影像组学的纹理分析检测出来。
SeeIt是一个支持多模态的影像组学软件,有了这个软件后,大家就可以很方便进行这方面的探索了。
软件及软件建立的项目文件,不要使用英文的目录名,不然提取特征时会报错,找不到文件。
2021.5.3 v0.12
- 原始版本
2021.7.31 v0.20
- 增加区域生长勾画病灶
- 单个图片支持多ROI区域
- 调整项目.prj文件格式,支持单层多ROI勾画,提高效率(0.20版项目文件与0.12版项目文件不兼容)
- 修改部分bug,提高程序效率
2021.8.8 v0.30
- 增加冠状位和矢状位图像特征提取
- 增加对于压缩DICOM支持
- 增加对头信息不全的DICOM图像支持
- 增加从网站获取软件更新信息
- 修改部分软件Bug
2021.8.14 v0.40
- 优化NRRD图像生成及特征提取,提速10倍上下(根据图像数目及ROI大小)
- 调整图像切换快捷为上下键,病灶切换为左右键
- 修正功能键锁定键开启时,shift按键绘制删除ROI的Bug
- 优化局部放大图像代码,大幅提升在放大图像中勾画操作的速度,消除迟滞。
- 优化勾画代码,即使在放大状态下,也可以高清勾画。
- 修改网络获取软件更新的代码,防止访问被腾讯服务器屏蔽
- 修改部分软件Bug
2021.8.22 v0.41
- 修改了非 512X512 矩阵图像显示错位的Bug
2021.8.28 v0.50
- 针对PET DICOM进行优化,可以统计和显示PET SUV值
- 增加ROI的3D显示功能,可以查看ROI勾画的三维效果
- 对热图的绘制进行修改,只显示模型最终筛选出的特征热图
- 优化直方图显示,改折线图为直方图
2021.9.4 v0.51
- 修改由于文件名错序导致导入图像错层问题
- 修改一些Bug
2021.9.11 v0.60
- 支持导入临床数据,第三方特征数据或是病人其他数据,联合进行建模。
- 调整建模算法,提高对于大数据建模的效率
- 修改部分软件Bug
2021.9.19 v0.70
- 增加导入第三方软件勾画ROI文件,如:nii,nrrd等
- 增加软件设置功能,使用者可以根据自己需求,调整软件部分参数
2021.10.10 v0.80
- 增加更多的特征提取参数控制
- 增加ROI勾画中阈值控制,可以指定最低,最大阈值或百分比
- 增加支持 nii或是nrrd 图像导入分析
- 修改部分软件Bug,增加稳定性