深度学习脑区分割 - 医学人工智能爱好者

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颅脑分割是脑科学的基础工作。颅脑功能及结构区域众多，即使是有经验的医生也需要很长时间才能完成，而且还会受到人的精力，情绪，耐心等波动因素的影响。

深度学习在图像分割领域相对于传统技术，有很强的优势。为了方便医生简单和快捷，对磁共振3D T1的图像进行分割，便制作了该软件。

该软件使用深度学习网络，将磁共振3D颅脑图像分割为132个区域，自动测量各个脑区的体积以及百分比，并可以对同一个体多次扫描的颅脑脑区，或是不同个体的颅脑脑区进行对比。

软件支持各厂商磁共振扫描标准DICOM图像文件或是nii或nii.gz图像文件，对比为T1加权对比。

软件在范德堡大学和MONAI开源架构（monai.io）的UNesT深度网络脑分割模型工作基础上开发完成，该模型遵从Apache 2.0许可（http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0）

Brain Segmentation

深度学习脑区分割

● 下载ZIP软件包，解压缩，无需安装

● 运行BrainSeg.exe

安装

图像区域操作

1. 放大图像：图像右侧（1/5区域），按下鼠标左键，上下移动。

2. 移动图像：图像右下角，按下鼠标左键，上下左右移动。

3. 调整图像窗宽和窗位：图像左侧（4/5区域），按下鼠标左键，上下左右移动。

4. 切换图像：载入的多幅图像，滚动鼠标滚轮进行切换。

5. 切换图像和病灶：通过键盘上的上、下、左、右按键。

使用说明

详见网页下方，使用介绍视频

更新记录

2022.10.23 v0.10

- 原始版本

2023.09.18 v0.11

- 修改部分Bug

注意事项

推荐计算机配置：GPU无要求，CPU核心越多越好，内存 ≥ 16G (分割时间，一般3-6分钟，<10分钟) (如果内存太小，比如，只有8G，计算机将使用硬盘作为缓存，导致分割时间成倍增加，我在我的I5的笔记本（4核，内存8G）上进行测试，需要30分钟才能完成分割）

该软件只用于学习，研究使用，未经作者同意，不能应用于商业用途。

此外，软件的启动文件BrainSeg.exe（用于启动Python或其他语言解释器），经常会被360软件认为是病毒。如果使用360安全卫士的用户，可以将启动软件添加为信任，或暂时关闭360，最好是使用其他杀毒软件。

使用介绍视频